Kompleks Danau Malili merupakan untaian danau yang terdiri dari Danau Matano, Danau Mahalona, Danau Towuti, Danau Wawontoa /Lantoa, dan Danau Masapi yang terletak di Kabupaten Luwu Timur, Sulawesi Selatan.
Nama Malili juga merupakan nama ibukota Kabupaten Luwu Timur, yang terletak di ujung utara Teluk Bone.